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腫瘤干細胞純生信套路視頻(mRNAsi干細胞指數/ W

時間:2019-09-16 12:19來源:生信自學網 作者:樂偉 點擊:
腫瘤干細胞純生信套路視頻



課程目錄:腫瘤干細胞文章套路簡介,轉錄數據下載,轉錄組數據整理,id轉換,臨床數據下載,臨床數據整理,mRNAsi差異,生存分析輸入文件準備,mRNAsi生存分析,臨床相關性輸入文件準備,mRNAsi臨床相關性,差異基因篩選,WGCNA共表達分析,Key基因提取,Key基因差異表達,Key基因熱圖繪制,Key基因相關性,Key基因蛋白互作網絡,基因名字轉換為id,Key基因GO富集分析,Key基因KEGG富集分析。

課程簡介:腫瘤干細胞(Cancer Stem Cell, CSC),是指腫瘤中具有自我更新能力并能產生異質性腫瘤細胞的細胞。腫瘤干細胞對腫瘤的存活、增殖、轉移及復發有著重要作用。
干細胞指數(stemness indices)是描述腫瘤細胞與干細胞相似性的指標。 mRNAsi是基于表達數據計算的指數, mDNAsi是基于甲基化數據計算的指數,EREG-mRNAsi指數是干細胞表觀調控相關基因的表達量訓練得到,指數范圍在0到1之間,約接近于1說明細胞分化程度越低,干細胞特征越強。




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責任編輯:樂偉
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