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基于ssGSEA的免疫基因集文章套路試學視頻(單樣本

時間:2019-09-16 12:07來源:生信自學網 作者:樂偉 點擊:
基于ssGSEA的免疫基因集文章套路視頻

課程目錄:

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內容簡介:

We analyzed 29 immune-associated gene sets which represented diverse immune cell types, functions, and pathways. We used the ssGSEA to quantify the activity or enrichment levels of immune cells, functions, or pathways in the cancer samples.

ssGSEA(single sample GSEA)主要針對單樣本無法做GSEA而提出的一種實現方法,原理上與GSEA是類似的。ssGSEA根據表達譜文件計算每個基因的rank值,再進行后續的統計分析。



 

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責任編輯:樂偉
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