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TCGA甲基化驅動基因高級課程

時間:2019-07-31 11:04來源:原創 作者:biowolf.cn 點擊:
TCGA數據庫挖掘又推出一門課程,甲基化驅動基因分析,是繼TCGA基礎課程,cox風險回歸模型,ceRNA網絡構建,TCGA甲基化差異分析生存分析之后的又一力作,從此TCGA挖掘又5門課程,是學習


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TCGA數據庫挖掘又推出一門課程,甲基化驅動基因分析,是繼TCGA基礎課程,cox風險回歸模型,ceRNA網絡構建,TCGA甲基化差異分析生存分析之后的又一力作,從此TCGA挖掘又5門課程,是學習分析的好資料,是論文開題的領路人。甲基化驅動基因課程是TCGA甲基化差異分析生存分析的高級課程,是當前分析的熱點,對論文思路構建寫作有很大的幫助。

TCGA數據庫包括豐富的數據類型和腫瘤類型,不需要任何費用即可獲得大量數據,其次在TCGA下載的數據已經經過了前期繁瑣的標準化處理,節省了人工處理時間和資源。 

甲基化驅動基因分析,主要用到MethyIMix分析方法:1、計算基因甲基化水平和基因表達相關性,找到顯著相關的基因。

2、對樣品甲基化程度構建混合模型(mixture model)

3、Wilcoxon rank test計算正常組和處理組的差異甲基化

4、對計算的p值進行矯正

課程包括以下及部分的內容:

1、甲基化驅動基因課程簡介

2、甲基化驅動基因數據準備

3、甲基化驅動基因MethyIMix數據分析

4、甲基化驅動基因MethyIMix繪制圖形

5、甲基化驅動基因熱圖繪制

6、甲基化驅動基因PATHWAY分析
甲基化驅動基因
甲基化驅動基因
甲基化驅動基因

 


責任編輯:樂偉
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