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  • [TCGA] 基于ssGSEA的免疫基因集簡介和分析過程 日期:2019-09-04 16:05:02 點擊:6160 好評:0

    ssGSEA——單樣本GSEA的方法,通過這個方法,我們可以得到每個樣本的免疫細胞或者免疫功能,免疫通路的活性,然后根據免疫活性進行分組。...

  • [TCGA] 自噬基因預后模型文章套路課程試學 日期:2019-08-13 17:41:13 點擊:6495 好評:0

    自噬基因預后模型文章套路視頻(autophagy/多指標ROC曲線)...

  • [TCGA] 自噬相關基因和腫瘤的關系 日期:2019-08-12 15:30:09 點擊:3246 好評:2

    如何用TCGA數據庫做自噬相關基因預后分析,是生信分析的一個新的熱點和難點,自噬相關基因的重要性決定了其研究的重要地位。...

  • [TCGA] 自噬基因的簡介和下載自噬基因 日期:2019-08-11 17:48:07 點擊:5254 好評:2

    如何獲取自噬基因::網址:http://www.autophagy.lu/...

  • [TCGA] TCGA甲基化分析再續經典課程 日期:2019-07-31 11:03:12 點擊:1404 好評:10

    TCGA甲基化分析是當前分析的熱點,也是TCGA分析的藍海,具有很強的分析價值。...

  • [TCGA] Cox比例風險回歸模型發文思路 日期:2019-07-31 11:01:54 點擊:1975 好評:6

    TCGA數據庫挖掘,癌癥分析首選數據庫,Cox比例風險回歸模型是TCGA分析一個非常重要的方法,同時也是一個發文熱點。...

  • [TCGA] 甲基化和基因表達聯合分析 日期:2019-07-31 10:43:11 點擊:2507 好評:10

    繼TCGA基礎課程、Cox風險模型、ceRNA網絡構建課程推出之后,在學員強烈要求下,我們的程序員、授課老師合理規劃,協同合作,經過半年的努力,終于推出了《TCGA甲基化基礎課程》、《...

  • [TCGA] TCGA臨床數據整理分析課程 日期:2019-07-31 10:18:06 點擊:4287 好評:20

    這注定是個不平凡的夏天,世界杯正在熱播,我們的研究沒有停歇,在這個忙碌的夏天,我們精心錄制了三個課程,現在各平臺均已上線,各位學員在看世界杯的空余,可以學習課程,...

  • [TCGA] TCGA突變數據如何做分析? 日期:2019-07-31 09:32:37 點擊:3704 好評:34

    TCGA突變數據分析...

  • [TCGA] 基于TCGA數據庫腫瘤免疫細胞浸潤分析流程 日期:2019-07-31 09:25:20 點擊:2877 好評:10

    在這個分析思路中,最關鍵的一步就是如何用CIBERSORT這個軟件把基因矩陣轉換為免疫細胞矩陣。...

  • [TCGA] 3到11分文章解讀(腫瘤免疫浸潤挖掘方向) 日期:2019-07-31 09:24:43 點擊:5608 好評:28

    免疫浸潤是一個非常經典的思路,通過簡單的基因矩陣數據,我們將復雜實驗才能提取的免疫細胞含量直接計算出來,對科研工作非常有幫助。今天我們來講講,通過腫瘤免疫浸潤分析...

  • [TCGA] GEO、TCGA、Oncomine應該選擇哪一個? 日期:2019-07-30 11:42:41 點擊:3594 好評:12

    大數據時代,生物數據越來越多了,數據庫也越來越多了,各種各樣的基因芯片數據庫、蛋白質數據庫...琳瑯滿目...

  • [TCGA] TCGA數據庫腫瘤微環境挖掘腫瘤免疫評分基質評分 日期:2019-07-30 11:40:51 點擊:4072 好評:10

    在腫瘤微環境中,免疫細胞和基質細胞是兩種主要類型的非腫瘤組分,并且已被提出對于腫瘤的診斷和預后評估具有價值的。...

  • [TCGA] TCGA數據庫腫瘤突變負荷分析(TMB/tumor mutation burd 日期:2019-07-30 11:40:22 點擊:3881 好評:14

    腫瘤突變負荷是一個比較熱門的分析,而且頻繁用于各大醫院臨床應用,通過腫瘤突變負荷的程度,可以預測生存期,以及病人的免疫治療的療效。...

  • [TCGA] m6A RNA甲基化生物信息學挖掘思路 日期:2019-07-30 11:31:39 點擊:3474 好評:4

    RNA修飾是一種轉錄后水平的調控方式,目前已鑒定到超過150種RNA修飾,它們廣泛分布于各類RNA,如信使RNA(mRNA)、轉運RNA(tRNA)、核糖體RNA(rRNA)、非編碼小RNA(sncRNA)和長鏈非編碼...

  • [TCGA] m6A-RNA甲基化(m6A RNA methylation)5分純生信文章解讀 日期:2019-07-30 11:29:37 點擊:2613 好評:4

    m6A RNA methylation文章解讀...

  • [TCGA] GTEx數據庫聯合TCGA做分析 日期:2019-07-30 11:21:55 點擊:3083 好評:6

    TCGA數據庫癌旁樣本少(沒有癌旁)怎么辦? GTEx數據庫聯合TCGA做分析 通常我們在挖掘TCGA數據庫的時候,會發現該項目納入的正常組織測序結果是非常少的,也就是說很多病人都不會有...

  • [TCGA] 還在傻傻的說TCGA沒有癌旁?GTEx來助力 日期:2019-07-30 07:26:55 點擊:5801 好評:6

    你是否遇到這樣的問題,TCGA癌旁太少甚至沒有,做免疫做到后面癌旁樣本只剩下5個一下的個位數,審稿人冷不丁的來一句這么少的癌旁有沒有意義?那么有了GTEx數據庫,有正常樣品助...

  • [TCGA] TMB腫瘤突變負荷的誕生和熱門 日期:2019-07-30 07:13:23 點擊:5495 好評:4

    既然免疫治療是否有抗癌效果,主要依賴于免疫細胞對癌細胞特異性抗原的識別;那么,從理論上講,那些攜帶基因突變越多的癌癥患者,癌細胞產生的新抗原越多,被免疫細胞識別的...

  • [TCGA] 十萬樣本深度挖掘TMB和PD-1 日期:2019-07-30 07:11:53 點擊:4288 好評:2

    詳細分析了10萬例腫瘤患者的標本和臨床資料,深度解析了有關TMB、PD-1抑制劑、MSI以及遺傳物質錯誤修飾等關鍵問題。...

  • [TCGA] 如何分組做COX模型驗證 日期:2019-07-29 23:12:44 點擊:5669 好評:4

    COX模型驗證如何分train組和test組,可以購買生信自學網錄制的專利視頻課程《COX模型驗證》...

  • [TCGA] 7種可變剪接類型(TCGA可變剪切) 日期:2019-07-29 23:03:55 點擊:6910 好評:2

    《TCGA數據庫可變剪切數據挖掘》5分套路分析課程正在制作,大家可以重點了解下7種可變剪切類型。...

  • [TCGA] TCGA數據庫可變剪切文獻解讀 日期:2019-07-29 23:01:26 點擊:5710 好評:4

    Genome-Wide Profiling of Prognostic Alternative Splicing Signature in Colorectal Cancer...

  • [TCGA] 可變剪切挖掘生信文章解讀 日期:2019-07-29 22:59:57 點擊:5537 好評:2

    【可變剪切文獻解讀】Alternative splicing events implicated in carcinogenesis and prognosis of colorectal cancer...

  • [TCGA] 8705例腫瘤樣本可變剪切綜合分析【文獻解讀】 日期:2019-07-29 22:54:11 點擊:6793 好評:2

    Comprehensive Analysis of Alternative Splicing Across Tumors from 8,705 Patients,8705例腫瘤樣本選擇性剪切的綜合分析...

  • [TCGA] TCGA甲基化驅動基因文獻解讀 日期:2019-07-29 22:48:58 點擊:6506 好評:0

    Exploration of methylation?driven genes for monitoring and prognosis of patients with lung adenocarcinoma 甲基化驅動基因監測肺腺癌患者預后的探討...

  • [TCGA] TCGA數據庫可變剪切數據挖掘簡介 日期:2019-07-10 14:20:23 點擊:5840 好評:2

    可變剪切(alternative splicing,AS),也叫做選擇性剪切,指的是再mRAN前體到成熟mRNA的過程當中,不同的剪切方式使得同一個基因可以產生多個不同的成熟mRNA,最終產生不同的蛋白質。...

  • [TCGA] TCGA數據庫后臺是如何規范TCGA樣品ID的? 日期:2019-03-01 12:33:14 點擊:1460 好評:8

    TCGA數據庫現在是生信分析的熱點,生信自學網開創了用生信方法解讀TCGA數據的先河,給研究者提供了新的研究方案。...

  • [TCGA] ceRNA網絡構建發文套路SCI快速發文 日期:2018-03-13 13:28:16 點擊:2698 好評:18

    學員又發文了,ceRNA網絡構建,原來SCI發文可以通過學習做到,而且只要認真學習我們的課程,課程的數據和結果可以直接上論文。...

  • [TCGA] TCGA數據庫挖掘甲基化分析 日期:2018-03-11 15:27:39 點擊:4054 好評:6

    而你看到的課程,是我們3個生信大神老師,經過半年對TCGA數甲基化數據魔鬼化分析得到大作。...

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