知識的價值不在于占有,而在于使用。

生信自學網-速科生物-生物信息學數據庫挖掘視頻教程

當前位置: 主頁 > TCGA >

自噬相關基因和腫瘤的關系

時間:2019-08-12 15:30來源:生信自學網 作者:樂偉 點擊:
如何用TCGA數據庫做自噬相關基因預后分析,是生信分析的一個新的熱點和難點,自噬相關基因的重要性決定了其研究的重要地位。
自噬是細胞在自噬相關基因(autophagy related gene,Atg)的調控下利用溶酶體降解自身受損的細胞器和大分子物質的過程。對實現細胞代謝需要、更新某些細胞器并維持細胞內穩態有較重要的作用。

近幾年,自噬研究的熱度不減,國自然相關研究的中標數量也呈增長趨勢,在2016年,自噬相關研究被授予了諾貝爾生理醫學獎

自噬是一種非常基礎的生命活動現象,它可能參與生命活動的方方面面,比如腫瘤、炎癥、免疫應答、氧化應激等。通常情況下,除了研究自噬現象本身,大家更多的是將自噬與各種生命活動或者疾病結合起來,把自噬作為這些方向的一個機制來研究。
比如研究自噬如何參與腫瘤的發生發展、如何參與腫瘤的耐藥性與復發轉移、如何參與腫瘤免疫治療的效果、自噬如何參與炎癥反應、自噬如何參與氧化應激,甚至自噬如何參與自閉癥、阿茲海默癥的發生與治療等。
 
自噬是真核細胞維持內環境穩態的一種內在平衡機制。大量證據表明自噬通路在多種疾病與生理過程中起著重要作用,如:神經系統疾病、腫瘤、心血管疾病、感染、代謝性疾病、自身免疫性疾病等等,自噬通路也就成為是很多疾病潛在的靶向治療通路。大隅良典因發現細胞自噬機制獲得2016年度的諾貝爾生理學或醫學獎
什么是自噬?
Autophagy(自噬)來自于希臘語,是auto=self和phagy=phagein=to eat的結合。細胞是怎么吃掉自己(self-eating)的呢?大致是一個通過膜將部分胞質和細胞內需降解的細胞器、蛋白質等組分包裹起來形成自噬體,后與溶酶體融合形成自噬溶酶體,最終降解其所包裹的內容物的過程。
自噬發生可以大概總結為以下幾個階段:
自噬泡(phagophore)的發生
自噬體(autophagosome)的形成
自噬的運輸融合(fusion):自噬體與溶酶體融合形成自噬溶酶體
自噬的降解(degradation)
 
近年來的研究表明,自噬參與惡性腫瘤、神經退行性疾病、組織纖維化、心血管疾病和免疫性疾病等多種疾病的發生和發展。按照細胞內底物被降解的方式和運送到溶酶體腔方式的差異,自噬被分為3 種類型:巨自噬(macroautophagy)、微自噬(microautophagy)、分子伴侶介導的自噬(chaperone-mediate autophgy)。因為巨自噬發生的普遍性,在大多數情況下巨自噬就是通常所說的自噬, 也是目前研究的最詳細的一種自噬形式。巨自噬不僅能降解大分子物質和細胞器來保護細胞,也通過自噬介導細胞發生自噬性細胞死亡,是真核生物細胞內調節降解蛋白、細胞器的主要機制。人類的疾病過程復雜,自噬與腫瘤之間的關系也未能完全明確。

在有些腫瘤中,自噬可以抑制腫瘤細胞的生長,激活細胞的程序性死亡。另外,自噬也可以通過多種機制和信號途徑對腫瘤的發生、發展進行雙向調節,使細胞在應激條件下得以存活,所以自噬對腫瘤的影響并不是單方面的有利或有害,其具體情況要對癌癥類型進行區別。自噬相關的多種關鍵分子被廣泛深入研究,發現該過程在酵母和人類中表現出高度的進化保守性。一系列酵母中自噬相關基因的同源物在哺乳動物中被廣泛發現,其中幾個核心的自噬相關基因在自噬體形成所必需的兩個泛素化系統中起作用。

生信自學課堂精品課程推薦:
免疫基因預后模型5分文章套路
《TCGA免疫細胞浸潤模式挖掘》
《TCGA腫瘤微環境》
《TCGA腫瘤突變負荷》

《單基因文章套路基于TCGA數據庫》


責任編輯:樂偉
作者申明:本文版權屬于生信自學網(微信號:18520221056)未經授權,一律禁止轉載!
加生信自學網群
BioWolf二維碼生成器
頂一下
(2)
66.7%
踩一下
(1)
33.3%
------分隔線----------------------------
發表評論
請自覺遵守互聯網相關的政策法規,嚴禁發布色情、暴力、反動的言論。
評價:
表情:
用戶名: 驗證碼:點擊我更換圖片
TCGA腫瘤微環境
推薦內容
單基因發文套路
m6A