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自噬基因的簡介和下載自噬基因

時間:2019-08-11 17:48來源:生信自學網 作者:樂偉 點擊:
如何獲取自噬基因::網址:http://www.autophagy.lu/
自噬(Autophagy)是通過溶酶體的水解酶非特異的降解細胞質中蛋白質、細胞器等底物的一種過程,是細胞正常生命活動的一部分。自噬異常往往是引起細胞損傷和老化的首要驅動因素,在腫瘤、衰老、炎癥、免疫應答、心腦血管疾病、氧化應激、神經退行性疾病、代謝、發育等生物學過程中幾乎都有自噬參與。

自噬和腫瘤關系
自噬(autophagy)是將細胞內受損、變性或衰老的蛋白質以及細胞器運輸到溶酶體進行消化降解的過程。
自噬在腫瘤中也扮演著這樣的雙面角色。正常生理情況下,細胞自噬利于細胞保持自穩狀態,細胞自噬還可以防止致癌的損傷蛋白質和細胞器的累積,抑制細胞癌變。然而腫瘤一旦形成,細胞自噬為癌細胞提供更豐富的營養,促進腫瘤生長。
在大多數情況下,自噬被認為是抑制早期腫瘤發生,促進已形成的腫瘤發展。
如何獲取自噬基因:

Autophagy這個網址也是文獻經常用到的數據庫之一
網址:http://www.autophagy.lu/


1、進入主頁之后我們選擇Clustering菜單,進入基因下載頁面


2、通過復制黏貼操作把這些自噬基因下載下來,用于后續分析
那么自噬基因可以做哪些分析呢?如何結合強大的TCGA癌癥數據庫做挖掘呢?
生信自學網即將上線的課程,為大家準備了經典的分析流程。

《自噬基因預后模型文章套路視頻(autophagy/多指標ROC曲線)》
流程圖諜照:


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責任編輯:樂偉
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