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生信自學網-速科生物-生物信息學數據庫挖掘視頻教程

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  • [生信數據庫] 單基因批量篩選之ROC過濾和臨床相關性過濾 日期:2019-08-30 16:28:56 點擊:6292 好評:2

    單基因批量篩選方法之ROC過濾和臨床相關性過濾...

  • [生信數據庫] 單基因批量篩選方法之獨立預后分析過濾 日期:2019-08-30 10:41:40 點擊:6382 好評:6

    通過前面的生存分析過濾之后,我們就得到了符合條件的一個新的矩陣,矩陣內的基因KM分析和Cox分析的P值都是小于0.001的,接下來我們做獨立預后分析過濾...

  • [生信數據庫] 單基因批量篩選方法之生存分析過濾 日期:2019-08-29 17:06:01 點擊:6670 好評:2

    單基因篩選過濾,層層篩選,層層過濾,用數據庫本身數據,得到最佳理想效果的基因。...

  • [生信數據庫] CGGA膠質瘤數據庫簡介和數據下載 日期:2019-08-25 16:44:29 點擊:5499 好評:2

    CGGA數據庫是一個用戶友好的網絡應用程序,用于數據存儲和分析,以探索來自中國隊列2000多個樣本的腦腫瘤數據集。...

  • [生信數據庫] PCA主成分分析詳解 日期:2019-07-31 11:19:11 點擊:2145 好評:10

    今天給大家推薦的是主成分分析,是一種掌握食物主要矛盾的統計學分析方法,它可以從多元事物中解析出主要影響因素,揭示事物的本質,簡化復雜的問題。...

  • [生信數據庫] WGCNA生信分析 日期:2019-07-31 10:17:55 點擊:1307 好評:6

    《WGCNA分析》課程 WGCNA(加權基因共表達網絡分析)利用基因表達數據,構建出加權的基因共表達網絡,從而挖掘協同表達的基因模塊,探索 基因模塊與性狀之間的關系。該課程主要介...

  • [生信數據庫] 小RNA測序分析數據下載miRNA、siRNA和piRNA 日期:2019-07-30 11:41:34 點擊:1292 好評:4

    小RNA是一類是長度在18-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。小RNA能夠調控基因的表達,在細胞生長、發育、代謝等基礎生物學過程中扮演著重要的角色。...

  • [生信數據庫] Tumor microenvironment characterization in gastric cancer id 日期:2019-07-30 11:38:34 點擊:1342 好評:4

    Tumor microenvironment characterization in gastric cancer identifies prognostic and immunotherapeutically relevant gene signatures 胃癌腫瘤微環境特征鑒定預后和免疫治療相關基因特征...

  • [生信數據庫] GSEA富集分析如何操作(GO/KEGG的第三個富集分析) 日期:2019-07-30 11:33:55 點擊:1497 好評:4

    除了做GO分析和KEGG分析外,最常用的,其實是GSEA分析(Gene Set Enrichment Analysis)。GSEA和普通的KEGG和GO分析不一樣的地方,是GSEA構建了一個分子標簽數據庫(MolecularSignaturesDatabase,MSigDB)...

  • [生信數據庫] 環狀RNA或成為新的癌癥標志物 日期:2019-07-30 07:33:40 點擊:5329 好評:2

    A Noncoding Regulatory RNAs Network Driven by Circ‐CDYL Acts Specifically in the Early Stages Hepatocellular Carcinoma。最新《Hepatology》:瞄準肝細胞癌早期篩查與精準治療...

  • [生信數據庫] 618生信自學網秒殺、團購、領券活動 日期:2019-07-30 07:24:46 點擊:7598 好評:4

    618生信自學網為學員準備了豐富的秒殺活動,砍價活動,生信自學課堂領券優惠活動,回饋廣大學員對生信自學網的大力支持...

  • [生信數據庫] 單細胞RNA測序生信分析簡介 日期:2019-07-30 07:23:40 點擊:4243 好評:2

    單細胞測序是指在單個細胞水平上進行測序。單細胞轉錄組測序(single cell RNA ,scRNA-seq)是指對于單個細胞水平上將mRNA反轉錄擴增后進行高通量測序的技術。...

  • [生信數據庫] TARGET兒童腫瘤數據庫下載臨床和mRNA-seq數據 日期:2019-07-30 07:14:35 點擊:3337 好評:2

    TARGET數據庫是兒童腫瘤數據庫,適合做兒童腫瘤分析和挖掘,對TCGA數據庫做了很好的補充,而且針對性更強。...

  • [生信數據庫] ArrayExpress數據庫挖掘(類似GEO數據庫的另一個芯片 日期:2019-04-19 06:46:27 點擊:1811 好評:8

    ArrayExpress與Geo數據庫類似,里面都存儲這大量芯片表達數據,對于數據庫挖掘的學員來說,ArrayExpress是一個不可或缺的數據庫。...

  • [生信數據庫] 中藥網絡藥理學分析思路探討 日期:2019-01-17 14:50:45 點擊:956 好評:-6

    網絡藥理學是基于系統生物學理論,對生物系統的網絡分析,選取特定信號節點進行多靶點藥物分子設計的新學科。...

  • [生信數據庫] R語言學習資料大全(持續更新) 日期:2017-11-07 11:54:22 點擊:2152 好評:2

    學習R語言可以利用很多資源,學習這些資源可以更好的學習R語言,生信分析R語言...

  • [生信數據庫] 高通量測序數據發文思路 日期:2017-08-15 07:27:17 點擊:2751 好評:8

    隨著高通量檢測(基因芯片/二代測序)價格的降低,全基因組檢測也成為較為常規的實驗之一。然而面對動輒幾萬個基因的高通量數據,后期的數據分析顯得尤為重要。...

  • [生信數據庫] TCGA差異基因做火山圖 日期:2017-08-12 07:13:14 點擊:7375 好評:2

    TCGA數據庫數據下載得到表達矩陣,用表達矩陣做差異分析,可以得到差異基因,以及差異基因相關的logFC和矯正后的P值,利用這兩列數據可以畫一個火山圖,直觀表示差異基因的上調下...

  • [生信數據庫] lncRNA深入分析方法 日期:2017-08-12 04:29:22 點擊:1240 好評:0

    長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA。 研究表明, lncRNA 在劑量補償效應(Dosage compensationeffect)、表觀遺傳調控、細胞周期調控和細胞分化調控等眾多生...

  • [生信數據庫] miRNA命名規則 日期:2017-08-11 20:23:04 點擊:1350 好評:0

    以動物microRNA為例 一、 確定命名規則之前發現的microRNA,則保留原來名字,如cel-let-7。 二、 在提交新的microRNA到數據庫時,按照microRNA family順序分別編號命名,如數據庫中已有mir-41,那...

  • [生信數據庫] Affymetrix芯片數據上傳到GEO數據庫 日期:2017-08-11 20:05:17 點擊:810 好評:6

    GEO數據庫上傳芯片數據...

  • [生信數據庫] circRNA環狀RNA功能分析 日期:2017-08-09 07:08:49 點擊:2651 好評:4

    circRNAs 由于其特有的結構和復雜的功能機制,對其研究起步較晚,但已證實其具有重要的調控作用并在疾病發生中發揮重要作用,成為 RNA 和轉錄組研究的熱點。...

  • [生信數據庫] PCA主成分分析 日期:2017-07-18 14:26:37 點擊:806 好評:-2

    主成分分析(Principal Component Analysis,PCA), 是一種掌握事物主要矛盾的統計分析方法,它可以從多元事物中解析出主要影響因素,揭示事物的本質,簡化復雜的問題。...

  • [生信數據庫] RCircos圈圖繪制 日期:2017-07-13 05:35:49 點擊:1512 好評:0

    RCircos圈圖用途廣泛,特別是二代測序的文章,在很多文章都會用上圈圖,SNP位點,基因的表達量,基因間的共表達關系,在生物學領域應用廣泛。...

  • [生信數據庫] 環狀RNA測序數據分析 日期:2017-07-10 12:05:05 點擊:428 好評:2

    環狀RNA簡介,環狀RNA注釋、鑒定,差異分析,生存分析...

  • [生信數據庫] R語言&軟件免費視頻教程 日期:2017-07-04 10:56:37 點擊:1110 好評:0

    生物信息學R語言系列課程由biowolf.cn原創錄制,旨在完善生物視頻教程生態圈,滿足廣大學員對R語言深入學習的要求,在之前的生信課程中,經常用到R軟件和R腳本,很多時候我們都會給...

  • [生信數據庫] 轉錄因子結合位點TFBS預測 日期:2017-06-27 13:23:00 點擊:533 好評:0

    課程講解轉錄因子及轉錄因子結合位點的預測,轉錄因子能夠結合在某因子上游特異核苷酸序列上的蛋白質,活化后從胞質轉位至胞核,通過識別和結合基因啟動子區的順式作用原件,...

  • [生信數據庫] 在線分析GDSC抗癌藥物敏感性數據庫 日期:2017-06-09 16:07:57 點擊:1258 好評:6

    GDSC數據庫進入網站就可以得到很多有用的數據,在線可以生成IC50半濃度圖,火山圖,單個多個癌癥的藥物敏感性散點圖,所以說這個數據庫非常實用。...

  • [生信數據庫] GDSC抗癌藥物敏感性數據庫分析簡介 日期:2017-06-09 15:59:16 點擊:2312 好評:0

    抗癌藥物敏感性基因組學(GDSC,Genomics of Drug Sensitibity in Cancer)有英國桑格研究院開發,收集腫瘤細胞對藥物的敏感度和反應。癌基因組的變異會影響臨床治療的效果,不同的靶點對藥...

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